Wrodzone Odporności i Ryzyko Astmy u Aryszów i Hutników ad 6

Solidna linia pozioma wskazuje 1% fałszywego wskaźnika wykrywania. Czarne punkty reprezentują geny z komórek Amish i Huterite, dla których nie było znaczącej różnicy w ekspresji genów. Różnice w ekspresji genów utrzymują się po wykluczeniu danych dla dzieci z astmą lub uczuleniem alergicznym (ryc. S6 i S7 w dodatkowym dodatku). Zmiany w ekspresji genów między dwiema grupami po korekcie różnic w proporcjach komórek pokazano na rysunku S4 w dodatkowym dodatku. W panelu B pokazano sieć genów o różnej ekspresji w nieleczonych leukocytach krwi obwodowej. Geny pokazane na niebiesko mają zwiększoną ekspresję u dzieci Amiszów, a gen pokazany na czerwono ma zwiększoną ekspresję u dzieci huterytów. Kształty genów wskazują klasę produktu białkowego każdego genu (spirale oznaczają enzymy, v-kształt oznacza cytokiny, połączone kręgi oznaczają regulator transkrypcji, puste trójkąty odwrócone oznaczają kinazy, kubki oznaczają transportery, a koła oznaczają inne produkty). Linie reprezentują różne zależności biologiczne (linie ciągłe oznaczają bezpośrednią interakcję, linie przerywane pośrednią interakcję, kierunek strzałki aktywacji, strzałki z poziomym kierunkiem linii aktywacji i hamowania oraz linie bez strzałki). Uderzające różnice w proporcjach leukocytów krwi obwodowej obserwowane u dzieci amiszów i hutytów znalazły odzwierciedlenie w profilach ekspresji genów tych komórek (ryc. S5 w dodatku uzupełniającym). Przy wskaźniku fałszywych odkryć wynoszącym 1%, 1449 genów było regulowanych w górę w leukocytach krwi obwodowej dzieci Amiszów (niebieskie punkty na Figurze 3A) w porównaniu z 1360 genami regulowanymi w górę w komórkach dzieci hutyckich (czerwone punkty na figurze). 3A). Te zróżnicowane ekspresje genów zostały zorganizowane w 15 modułów koekspresyjnych z wykorzystaniem analizy sieci ekspresji całego genomu (tabela S9 w dodatkowym dodatku). Aby lepiej zrozumieć związki biologiczne w obrębie każdego zestawu genów w każdym module, wykorzystaliśmy analizę Ingenuity Pathway (Qiagen) do skonstruowania nienadzorowanych sieci na podstawie wcześniejszej wiedzy o fizycznych i funkcjonalnych połączeniach między cząsteczkami kodowanymi przez geny. Najbardziej znacząca sieć (P = 1,0 × 10-30 według dokładnego testu Fishera) była w module, który zawierał 43 geny. Moduł ten był związany zarówno ze stanem Amisha, jak i Hutterytu (P = 7,1 × 10-9), a zatem był również związany z odsetkiem neutrofili (P = 1,5 × 10-6) i eozynofilów (P = 1,0 × 10-3). Osiemnaście genów w tym module uległo nadmiernej ekspresji w leukocytach Amish z krwi obwodowej, a wszystkie były skupione w sieci, która miała jako koncentrator czynnik martwicy nowotworów (TNF) i czynnik regulujący interferon 7 (IRF7), dwa kluczowe białka we wrodzonej odpowiedzi immunologicznej do bodźców mikrobiologicznych (Figura 3B).
Wpływ wyciągów z domu na pył na eksperymentalną astmę
Rycina 4. Ryc. 4. Wpływ ekstraktów z domieszką amish i Huterytów na reakcje dróg oddechowych w modelach mysich astmy alergicznej.Panel A pokazuje wpływ wdychania donosowego 50 .l ekstraktu z pyłu Amish lub Hutterite u 7-tygodniowych myszy (Szczep BALB / c) co 2 do 3 dni, łącznie 14 razy począwszy od dnia 0
[podobne: stomatologia estetyczna, implanty zębów, Stomatolog Kraków ]

Wrodzone Odporności i Ryzyko Astmy u Aryszów i Hutników ad 6

Solidna linia pozioma wskazuje 1% fałszywego wskaźnika wykrywania. Czarne punkty reprezentują geny z komórek Amish i Huterite, dla których nie było znaczącej różnicy w ekspresji genów. Różnice w ekspresji genów utrzymują się po wykluczeniu danych dla dzieci z astmą lub uczuleniem alergicznym (ryc. S6 i S7 w dodatkowym dodatku). Zmiany w ekspresji genów między dwiema grupami po korekcie różnic w proporcjach komórek pokazano na rysunku S4 w dodatkowym dodatku. W panelu B pokazano sieć genów o różnej ekspresji w nieleczonych leukocytach krwi obwodowej. Geny pokazane na niebiesko mają zwiększoną ekspresję u dzieci Amiszów, a gen pokazany na czerwono ma zwiększoną ekspresję u dzieci huterytów. Continue reading “Wrodzone Odporności i Ryzyko Astmy u Aryszów i Hutników ad 6”

Powiązane tematy z artykułem: cennik implantów chirurgiczne usuwanie ósemek implanty zielona góra